Основные научные результаты Филаретовой Л.П. получены при изучении механизмов регуляции и адаптационных эффектов гипоталамо-гипофизарно-адренокортикальной системы. Автор концепции о физиологической гастропротективной роли глюкокортикоидных гормонов, продуцирующихся при стрессе, которая пересматривает традиционные представления об этих гормонах как ульцерогенных факторах. Экспериментально обосновано представление о компенсаторном гастропротективном действии глюкокортикоидных гормонов при ингибировании других гастропротективных факторов, в том числе и таких важных как простагландины. Ею установлено, что первичной мишенью действия глюкокортикоидных гормонов при реализации их гастропротективного влияния могут быть различные звенья общего гомеостаза.
Под руководством Филаретовой Л.П. защищены 2 кандидатские диссертации. Заместитель главного редактора «Российского физиологического журнала им. И. М. Сеченова» РАН, член редколлегий журналов Endocrine Regulation, World J. Gastrointestinal Pathophysiology, Inflammopharmacology
Член Ученого и диссертационного советов Института физиологии им. И. П. Павлова РАН и диссертационного совета Института эволюционной физиологии и биохимии им. И. М. Сеченова РАН. Лауреат именной научной стипендии Фонда содействия отечественной науке при Президиуме РАН для выдающихся российских ученых по категории «молодые доктора наук» 2001–2002 гг.